building_block.style_pvalue, p_stars

p-値のフォーマットを変更する関数

概要

 R言語の style_pvalue()gtools::stars.pval() をオマージュした関数でp-値を見やすい形のフォーマットに変換します。

style_pvalue(
    p_value: ArrayLike,
    digits: int = 3,
    prepend_p: bool = False,
    p_min: float = 0.001,
    p_max: float = 0.9
    )

p_stars(
    p_value, 
    stars = {'***':0.01, '**':0.05, '*':0.1}
    )

引数 Argument

  • p_valuescalar or array-like of int or float
  • digitsintstyle_pvalue() のみ)
     小数点以下の桁数
  • prepend_pboolstyle_pvalue() のみ)
     出区力に接頭辞 ’p’ を追加するかどうかを表す論理値。False であれば追加されず、True であれば追加されます。
  • p_minintstyle_pvalue() のみ)
     p-値を実数値で表示する最小値。p_value がこの値を下回る場合、’<p_min’ もしくは ’p<p_min’ の形で表示されます。
  • p_maxintstyle_pvalue() のみ)
     p-値を実数値で表示する最大値。p_value がこの値を下回る場合、’>p_max’ もしくは ’p>p_max’ の形で表示されます。
  • starsdictp_stars() のみ)
     有意性を示す記号を key に、表示を切り替える閾値を値(value)にもつ辞書オブジェクト。初期設定の stars = None の場合、{'***': 0.01, '**': 0.05, '*': 0.1} が使用されます。詳細は下記を参照して下さい。

返り値 Value

 フォーマットされたp-値を表す pd.Series を出力します。building_block.style_pvalue() では引数 p_value に与えられた数値を指定された桁数に丸めた値を表示し、指定された範囲を外れる値については ’<p_min’ や ’>p_max’の書式にへんかんします。  building_block.p_stars()では仮説検定の有意性を示すアスタリスク*` に変換します。初期設定ではアスタリスクはp-値の値に応じて次のように表示されます。

  • p ≤ 0.1 *
  • p ≤ 0.05 **
  • p ≤ 0.01 ***
  • p > 0.1 表示なし

使用例 Examples


from py4stats import building_block as build
p_value = [
    0.999, 0.5028, 0.2514, 0.197, 0.10, 
    0.0999, 0.06, 0.03, 0.002, 0.0002
    ]

print(build.style_pvalue(p_value).to_list())
#> ['>0.9', '0.503', '0.251', '0.197', '0.1', '0.1', '0.06', '0.03', '0.002', '<0.001']

print(build.style_pvalue(p_value, prepend_p = True).to_list())
#> ['p>0.9', 'p=0.503', 'p=0.251', 'p=0.197', 'p=0.1', 'p=0.1', 'p=0.06', 'p=0.03', 'p=0.002', 'p<0.001']

print(build.p_stars(p_value).to_list())
#> ['', '', '', '', '*', '*', '*', '**', '***', '***']

# R言語の stats::summary.lm() や gtools::stars.pval() を再現する場合。
stars_dict = {'***':0.001, '**':0.01, '*': 0.05, '.':0.1}
print(build.p_stars(p_value, stars = stars_dict).to_list())
#> ['', '', '', '', '.', '.', '.', '*', '**', '***']

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